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卵巢透明细胞癌 整合基因组和转录组分析揭示免疫亚型和预后标志物
作者: 来源: 发布时间:2022-03-25
复旦大学附属肿瘤医院杨慧娟等报告的一项研究显示,一种免疫亚型的卵巢透明细胞癌(OCCC)生存较差,且PD-1和PI3K-AKT-mTOR信号通路富集。该研究筛选并验证了OCCC患者较强的预后免疫标志物。(Br J Cancer. 2022年1月18日在线版 DOI:10.1038/s41416-022-01705-w)
研究者进行了一项整合的基因组和转录组分析,以识别免疫相关通路的分子亚型和预后标记物。共对50例中国患者进行了靶向二代测序和转录组测序。
根据免疫通路相关的系统聚类,两个不同的亚组被确定为免疫(22.0%)和非免疫(78.0%)。令人惊讶的是,免疫亚型患者的生存明显较差。在外部队列中验证了预后能力。免疫组有更高的促炎和检查点基因表达。PD-1信号通路在免疫亚型中富集。
此外,免疫簇中参与上皮-间充质转化、血管生成和PI3K-AKT-mTOR信号转导的基因表达丰富,而非免疫亚型中代谢通路表达较高。免疫亚型PIK3CA突变率较高,但未见显著性。最后,研究确立了总生存的预后免疫特征。有趣的是,免疫特征也适用于肾透明细胞癌,但不适用于其他组织学类型的卵巢癌。
(编译 陈翔)
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